Ein übergeordnetes Grundprinzip der palladianischen Villa bildet das achsiale System, dem sowohl die Anordnung der Baukörper untereinander als auch die Grundrißdisposition der 'casa del padrone' unterworfen sind.

Die Villa Badoer ist ein typisches Beispiel für die triadische Komposition der Villen dieses Typs mit dem Herrenhaus als Zentrum, zu dessen vertikaler Mittelachse die Flügel mit den Wirtschaftsgebäuden symmetrisch angelegt sind.

Der Grundriß der 'casa del padrone' weist eine dreiteilige, hierarchisch gestaffelte Struktur auf: die Loggia bildet den Eingangsbereich und bestimmt in ihrer Breite die dominierende mittlere Achse, die die langgestreckte Sala mit vier flankierenden Zwischenräumen umfaßt. Seitlich ist jeweils eine schmale Raumachse angefügt, die auf der Höhe der Zwischenräume einmal unterteilt wurde. Anschaulich wird diese Regularisierung in der Koordination der Blickachsen entlang der Längs- und der Querachse.