Bei der Rekonstruktion des ursprünglichen Projekts nach Tavernor 1998 sind auch die Maßverhältnisse von Interesse. Das Langhaus ist hier 40 braccia weit, 60 braccia hoch und 120 braccia lang (der braccio, die Elle, war ein gängiges Längenmaß der Zeit).
Alberti hätte demnach kommensurable Raumproportionen gewählt, einfache numerische Zahlenverhältnisse also, wie sie auch bei Vitruv und in Albertis eigenen theoretischen Schriften verwendet wurden. In diesem Fall entsprechen sie mit dem Verhältnis 2:6:3 der perfekten Konsonanz der musikalischen Harmonien.

Entscheidend ist dabei allerdings nicht das abstrakte mathematische Verhältnis der Ausmaße, sondern die Gestaltung der Raumform, die Alberti hier entwickelt hat.